Oxford Nanopore发布新产品PromethION

2014-10-30 10:27 · sunon

在今年的发布ASHG上，Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的新产神秘面纱。PromethION是发布一款平板电脑大小的台式测序仪，不过要比iPad大一些。新产这款仪器维持了MinION的发布简单易用、软件直观和极少样品制备，新产能够带来低成本、发布可扩展且长读取的新产测序，适合那些对流程灵活性有着更好要求的发布用户。

Oxford Nanopore似乎与ASHG（美国人类遗传学协会的新产年会）有着不解之缘。在ASHG 2012上，发布Oxford Nanopore展示了MinION的新产真机。在ASHG 2013上，发布它又宣布启动MinION的新产早期试用计划。而在今年的发布ASHG上，Oxford Nanopore揭开了其新产品PromethION的神秘面纱，并宣布了测序仪的一些更新。

PromethION是一款平板电脑大小的台式测序仪，不过要比iPad大一些。这款仪器维持了MinION的简单易用、软件直观和极少样品制备，能够带来低成本、可扩展且长读取的测序，适合那些对流程灵活性有着更好要求的用户。

纳米孔是以模块化的方式排列的，Oxford Nanopore称之为Nanopore cassettes。这些cassettes可根据需要来添加。你可以增加或减少流动槽的数量，而不需要让仪器满负荷地运作，以便维持每个样品的成本。

流动槽设计意味着只需要少量样品。据介绍，几微升样品即可产生足够的数据。流动槽包含一排孔，其中每个孔都 有一个可独立寻址的电子通道。纳米孔就在这些孔的膜上，而单分子就是利用纳米孔分析的。Nanopore cassettes兼容多孔板，便于上样自动化和单次实验中多个样品的追踪。

Oxford Nanopore还提出了一个“Run until”的概念。PromethION设备让用户能运行实验，直到获得足够量的数据，或有足够高质量的数据达到预设的实验终点。相比之下，其他分析系 统都有着固定的分析时间，在运行结束时带来一批固定的数据。在这种情况下，用户不得不设计实验，以满足仪器的性能。

相反，通过利用纳米孔传感的性质和快速电子测定，用户能够指示PromethION，以监控其自身的数据输出，并寻找应用特异的结果。利用这些结果，用户可以实时地改变或优化仪器的行为，或在获悉实验完成后停止仪器。

关于PromethION，还有个与众不同的地方，那就是Oxford Nanopore似乎将其核心软件从Windows转移到iOS系统。从官网以及展会上的图片可以看出，PromethION的分析系统似乎是iPad。 据悉，PromethION将在2015年年初启动早期试用计划。有意的读者请关注生物通的后续报道。

Oxford的首席技术官Clive Brown在会议上介绍了纳米孔测序仪的一些更新。他们提出了一种可编程的实时靶向测序方法（确切名称还不清楚）。比如，一个人希望从基因组的特定区域测 序，而不是其他区域。当reads通过纳米孔并测序时，比对部分序列，以找到它所在的区域。如果是感兴趣的区域，就让纳米孔继续测序。如果不是，纳米孔会 在特定孔上施加电势差，这样孔就会释放read，准备测序下一个read。这听上去是不是很神奇？那我们就拭目以待吧。

(责任编辑：娱乐)